CURRICULUM di Susanna Cogoi PhD
Dr. Susanna Cogoi
Dipartimento di Scienze Mediche e Biologiche
Università di Udine
Piazzale kolbe, 4
33100 Udine
Tel. 0432 494393
e-mail: susanna.cogoi@uniud.it
Da parecchi anni Susanna Cogoi si occupa di studiare i meccanismi coinvolti nella formazione di alcuni tumori e terapie innovative volte a combatterli. Ha lavorato all’Università di Trieste, al Laboratorio Nazionale CIB di Trieste (AREA Science Park, Trieste, Italy) e all’Università di Udine. Susanna Cogoi ha avuto vari contratti e ha vinto sia assegni che borse di ricerca riuscendo a mantenere la continuità nel lavoro. Ha ottenuto il titolo di dottore di ricerca in Diagnosi e Terapie Cellulari e Molecolari (Università di Udine).
In particolare negli ultimi anni ha studiato gli oncogeni KRAS e HRAS coinvolti rispettivamente nella progressione neoplastica di tumori del pancreas e della vescica; i promotori di tali oncogeni contengono sequenze in grado di assumere strutture a quadrupla elica. Tali strutture modulano la funzionalità dei promotori agendo da interruttori molecolari e sono quindi possibili bersagli per l’inibizione della proliferazione delle cellule tumorali. I risultati ottenuti in tali studi sono stati pubblicati su varie riviste internazionali.
Nel laboratorio del prof. Xodo oltre a svolgere personalmente parte degli esperimenti, coordina gli studi sulle quadruple eliche, si occupa dell’organizzazione del laboratorio e dell’inserimento di nuovi studenti.
E’ stata correlatrice di varie tesi di laurea e di dottorato di ricerca.
Susanna Cogoi si è occupata di vari corsi pratici nell’ambito medico o biotecnologico ed è attualmente docente a contratto di Biochimica.
Ha ottenuto sia l’Abilitazione alla Professione di Biologo che l’Abilitazione Scientifica Nazionale alle funzioni di professore di seconda fascia in Biochimica Generale e Biochimica Clinica (settore concorsuale 05/E1).
Susanna Cogoi ha 36 pubblicazioni indicizzate nella medline e 23 abstract e/o poster.
Studi ed esperienze lavorative:
- 1988-92 corso di laurea in Scienze Biologiche con indirizzo Biochimico presso l’Università di Trieste
1992-93 internato presso il prof. Giancotti al BBCM dell’Università di Trieste
1993 laurea a pieni voti in Scienze Biologiche presso l’Università di Trieste discutendo una tesi sperimentale dal titolo “Studio dell’espressione delle proteine HMGI in cellule tumorali mediante l’uso di anticorpi policlonali”.
- 1994-1996 contratto di collaborazione per svolgere ricerche su fattori di trascrizione eritroidi con la supervisione del prof. Santoro presso il Laboratorio Nazionale CIB di Trieste.
- 1995 supera l’esame di Stato per l’abilitazione alla professione di biologo.
- 1996-2000 dottorato di ricerca in “Diagnosi e Terapie Cellulari e Molecolari”, XII ciclo di durata quadriennale presso l’Università di Udine la prima parte è stata svolta sul metabolismo lipidico in cellule epatiche presso il laboratorio di Gastroenterologia, la seconda riguarda la modulazione dell’espressione di oncogeni mediante la formazione di triple eliche presso il laboratorio di biochimica del prof. Xodo, Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università di Udine.
2001 consegue il titolo di Dottore di Ricerca in Diagnosi e Terapie Cellulari e Molecolari presso l’Università degli Studi di Udine con una tesi dal titolo “Strategie anti-gene per il controllo della proliferazione neoplastica”, relatori il prof. L. Xodo e il prof. F. Quadrifoglio.
- 2001-4 assegno di ricerca dal titolo “Strategie anti-gene per il controllo della proliferazione delle cellule Panc-1 di carcinoma pancreatico mediante l’utilizzo di oligonucleotidi modificati anti Ki-ras.” presso il laboratorio del prof. Xodo al Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.
- 2005 contratto di collaborazione all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Studio della funzione trascrizionale di NHE (nuclear hypersensitive element) nel promotore dell’oncogene K-ras e uso di aptameri a scopo terapeutico.” presso il laboratorio del prof. Xodo al Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.
- 2006-7 borsa di ricerca biennale per sviluppare una ricerca dal tema “Meccanismo di regolazione della trascrizione di KRAS: ruolo svolto dalle sequenze polipuriniche - polipirimidiniche” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.
- 2008-9 contratto di collaborazione all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Colture cellulari, purificazione di proteine, transfezioni, dosaggi real-time PCR di trascritti” per le esigenze del progetto di ricerca dal titolo “Characterization of a regulatory cis-element of oncogenic KRAS and strategies to down-regulate transcription” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.
- 2009 contratto di collaborazione all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Colture cellulari, purificazione di proteine, transfezioni, dosaggi real-time PCR di trascritti” per le esigenze del progetto di ricerca dal titolo “Formazione di strutture G-quadruplex nel promotore di KRAS e loro coinvolgimento nel controllo della trascrizione.” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.
- 2009-11 contratto di collaborazione all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Meccanismo di regolazione della trascrizione nei geni RAS e identificazione di proteine specifiche per G4-DNA” per le esigenze del progetto di ricerca dal titolo “Formazione di strutture G-quadruplex nel promotore di KRAS e loro coinvolgimento nel controllo della trascrizione” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.
- 2012 ad oggi assegno di ricerca dal titolo: “Studio della regolazione del promotore di KRAS e sviluppo di oligonucleotidi decoy per inibire la trascrizione a scopo terapeutico.” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze Mediche e Biologiche, Università degli Studi di Udine.
- 2014 ottiene l’Abilitazione Scientifica Nazionale alle funzioni di professore di seconda fascia per il settore concorsuale 05/E1 Biochimica generale e biochimica clinica.
Partecipazione a progetti:
partecipazione scientifica a progetti di ricerca internazionali e nazionali, ammessi al finanziamento sulla base di bandi competitivi che prevedano la revisione tra pari
-PRIN 2001 Utilizzo di nuovi effettori anti-gene e antisenso per il controllo della proliferazione di cellule tumorali: oligonucleotidi legati al glicole polietilenico, PNA coniugato a peptidi basici. Durata: 22 mesi.
-PRIN 2003 Utilizzo di PNA coniugato al polietileneglicole e a peptidi basici per inibire la progressione neoplastica di cellule di carcinoma pancreatico. Durata: 22 mesi.
-PRIN 2007 Formazione di strutture G-quadruplex nel promotore di KRAS e loro coinvolgimento nel controllo della trascrizione. Durata: 3 mesi.
-AIRC 2007 Characterization of a regulatory cis-element of oncogenic Kras and strategies to downregulate transcription. Durata: 24 mesi.
-PRIN 2009 Sviluppo di oligonucleotidi G-decoys ad elevata attività antiproliferativa specifici per gli oncogeni umani KRAS e HRAS. Durata: 6 mesi.
-AIRC 2010 Molecular targeting of oncogenes: rationale design of anticancer drugs directed against KRAS. Durata: 33 mesi.
Pubblicazioni recenti di maggior rilievo:
Cogoi S, Paramasivam M, Spolaore B and. Xodo LE (2008) Structural polymorphism within a regulatory element of the human KRAS promoter: formation of G4-DNA recognized by nuclear proteins. Nucleic Acids Res. 36: 3765-80.
Cogoi S, Paramasivam M, Filichev V, Géci I, Pedersen EB, Xodo LE (2009) Identification of a new G-quadruplex motif in the KRAS promoter and design of pyrene-modified G4-decoys with antiproliferative activity in pancreatic cancer cells. J Med Chem, 52: 564-8.
Cogoi S, Paramasivam M, Membrino A, Yokoyama KK, Xodo LE. (2010) The KRAS promoter responds to Myc-associated zinc finger and poly(ADP-ribose) polymerase 1 proteins, which recognize a critical quadruplex-forming GA-element. J Biol Chem. 285(29): 22003-16.
Cogoi S, Shchekotikhin AE, Membrino A, Sinkevich YB, Xodo LE. (2013) Guanidino anthrathiophenediones as G-quadruplex binders: uptake, intracellular localization and anti Harvey-ras gene activity in bladder cancer cells. J Med Chem. 56(7): 2764-78.
Cogoi S, Zorzet S, Rapozzi V, Géci I, Pedersen EB, Xodo LE. (2013) MAZ-binding G4-decoy with locked nucleic acid and twisted intercalating nucleic acid modifications suppresses KRAS in pancreatic cancer cells and delays tumor growth in mice. Nucleic Acids Res., 41(7): 4049-64.
Cogoi S, Shchekotikhin AE, Xodo LE. (2014) HRAS is silenced by two neighboring G-quadruplexes and activated by MAZ, a zinc-finger transcription factor with DNA unfolding property. Nucleic Acids Res. 42(13): 8379-88.
Alcune attività didattiche:
- 16-20 luglio 2001 componente del corso opzionale pratico BCH-202 dal titolo “Modulazione dell’espressione di oncogeni mediante molecole antisenso a PNA” presso la Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università degli Studi di Udine.
- Anno Accademico 2003-2004 contratto per lo svolgimento del modulo di Esercitazioni di Chimica Biologica di 20 ore per il corso integrato di Biochimica I presso il Corso di Laurea Interfacoltà di Biotecnologie dell’Università degli Studi di Udine, settore scientifico disciplinare BIO/10 Biochimica.
- Anno Accademico 2012-13 laboratorio di Biochimica nell’ambito del II modulo del corso “Equilibrio chimico, omeostasi degli elettroliti e regolazione acido-base nell'organismo umano.” Tenuto dal prof. Xodo presso la Scuola Superiore dell’Università di Udine.
- Dall’anno Accademico 2012-13 ad oggi contratti di docenza temporanea per l’insegnamento di Biochimica (BIO/10) di 24 ore nel Corso Integrato di Meccanismi Biologici Fondamentali presso il Corso di Laurea in Infermieristica, sede di Pordenone, dell'Università degli Studi di Udine.
Co-relatrice in varie tesi tra cui:
2008 Alexandro Membrino: Corso di Laurea Specialistica in Biotecnologie Sanitarie indirizzo medico presso la Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Udine, Udine, tesi di Laurea sperimentale intitolata: “Polimorfismo strutturale nel promotore dell’oncogene KRAS e interazione di hnRNP A1 con strutture G4-DNA.”
2009 Manikandan Paramasivam: Dottorato di Ricerca in Scienze Biomediche e Biotecnologiche Università degli Studi di Udine, Udine, con una tesi intitolata “Structural polymorphism in the KRAS promoter: implications for transcription and therapy.”
2011 Alexandro Membrino: Dottorato di Ricerca in Scienze Biomediche e Biotecnologiche Università degli Studi di Udine, Udine, con una tesi intitolata: “G4-DNA in gene promoters and development of anticancer strategies.”
2013 Clara Bisaro: Corso di Laurea Specialistica in Chimica e Tecnologie Farmaceutiche, Università degli Studi di Trieste, Trieste, tesi di Laurea sperimentale dal titolo: “Attività antigenica di antratiofenedioni in cellule tumorali di vescica”.
Divulgazione:
Lotta contro il male: strategie anti-tumorali a scopo terapeutico. di Susanna Cogoi poster presentato alla Notte dei ricercatori Università di Udine, via Margreth 3 e via Grazzano 16, 27 settembre 2013 a Udine.
Altro:
Co-organizzatrice di “International Workshop on Molecular Pathways in the Response of Tumours to Photodynamic Therapy” svoltosi il 9-10 settembre 2011 a Udine (Italy).
Guest editor nella pubblicazione del Forum on Immunopathological Diseases and Therapeutics “Molecular Pathways in the Response of Tumours to Photodynamic Therapy” vol. 2, Issue 3, 2011 edito da Begell House, inc. Publishers, ISSN 2151-8017, ISSN on line 2151-8025.