Curriculum di Susanna Cogoi

CURRICULUM di
Susanna Cogoi PhD

 

Dr. Susanna Cogoi

Dipartimento di Scienze Mediche e Biologiche

Università di Udine

Piazzale kolbe, 4

33100 Udine

Tel. 0432 494393

e-mail: susanna.cogoi [at] uniud.it

 

Da parecchi anni Susanna Cogoi si occupa di
studiare i meccanismi coinvolti nella formazione di alcuni tumori e terapie
innovative volte a combatterli. Ha lavorato all’Università di Trieste, al
Laboratorio Nazionale CIB di Trieste (AREA Science Park, Trieste, Italy) e all’Università
di Udine. Susanna Cogoi ha avuto vari contratti e ha vinto sia assegni che
borse di ricerca riuscendo a mantenere la continuità nel lavoro. Ha ottenuto il
titolo di dottore di ricerca in Diagnosi e Terapie Cellulari e Molecolari (Università
di Udine).

In particolare negli ultimi anni ha studiato
gli oncogeni KRAS e HRAS coinvolti rispettivamente nella progressione
neoplastica di tumori del pancreas e della vescica; i promotori di tali
oncogeni contengono sequenze in grado di assumere strutture a quadrupla elica. Tali
strutture modulano la funzionalità dei promotori agendo da interruttori
molecolari e sono quindi possibili bersagli per l’inibizione della proliferazione
delle cellule tumorali. I risultati ottenuti in tali studi sono stati pubblicati
su varie riviste internazionali.

Nel laboratorio del prof. Xodo oltre a
svolgere personalmente parte degli esperimenti, coordina gli studi sulle
quadruple eliche, si occupa dell’organizzazione del laboratorio e
dell’inserimento di nuovi studenti.

E’ stata correlatrice di varie tesi di laurea
e di dottorato di ricerca.

Susanna Cogoi si è occupata di vari corsi
pratici nell’ambito medico o biotecnologico ed è attualmente docente a
contratto di Biochimica.

Ha ottenuto sia l’Abilitazione alla
Professione di Biologo che l’Abilitazione Scientifica Nazionale alle funzioni
di professore di seconda fascia in Biochimica Generale e Biochimica Clinica
(settore concorsuale 05/E1).

Susanna Cogoi ha 36 pubblicazioni indicizzate
nella medline e 23 abstract e/o poster.

 

Studi ed esperienze
lavorative:

-         
1988-92 corso di laurea in Scienze
Biologiche con indirizzo Biochimico presso l’Università di Trieste

1992-93
internato presso il prof. Giancotti al BBCM dell’Università di Trieste

1993 laurea
a pieni voti in Scienze Biologiche presso l’Università di Trieste discutendo
una tesi sperimentale dal titolo “Studio dell’espressione delle proteine HMGI
in cellule tumorali mediante l’uso di anticorpi policlonali”.

-         
1994-1996 contratto di collaborazione
per svolgere ricerche su fattori di trascrizione eritroidi con la supervisione
del prof. Santoro presso il Laboratorio Nazionale CIB di Trieste.

-         
1995 supera l’esame di Stato per
l’abilitazione alla professione di biologo.

-         
1996-2000 dottorato di ricerca in
“Diagnosi e Terapie Cellulari e Molecolari”, XII ciclo di durata quadriennale
presso l’Università di Udine la prima parte è stata svolta sul metabolismo
lipidico in cellule epatiche presso il laboratorio di Gastroenterologia, la
seconda riguarda la modulazione dell’espressione di oncogeni mediante la
formazione di triple eliche presso il laboratorio di biochimica del prof. Xodo,
Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università di Udine.

2001 consegue il titolo di
Dottore di Ricerca in Diagnosi e Terapie Cellulari e Molecolari presso l’Università
degli Studi di Udine con una tesi dal titolo “Strategie anti-gene per il
controllo della proliferazione neoplastica”, relatori il prof. L. Xodo e il
prof. F. Quadrifoglio.

-         
2001-4 assegno di ricerca dal titolo
“Strategie anti-gene per il controllo della proliferazione delle cellule Panc-1
di carcinoma pancreatico mediante l’utilizzo di oligonucleotidi modificati anti
Ki-ras.” presso il laboratorio del prof. Xodo 
al Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli
Studi di Udine.

-         
2005  contratto
di collaborazione all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Studio
della funzione trascrizionale di NHE (nuclear hypersensitive element) nel
promotore dell’oncogene K-ras e uso di aptameri a scopo terapeutico.” presso il
laboratorio del prof. Xodo  al
Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di
Udine.

-         
2006-7 borsa di
ricerca biennale per sviluppare una ricerca dal tema Meccanismo di
regolazione della trascrizione di KRAS: ruolo svolto dalle sequenze polipuriniche
- polipirimidinichepresso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di
Scienze e Tecnologie Biomediche, Università
degli Studi di Udine. 

-         
2008-9 contratto di collaborazione
all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Colture cellulari, purificazione
di proteine, transfezioni, dosaggi real-time PCR di trascritti” per le esigenze
del progetto di ricerca dal titolo “Characterization of a regulatory
cis-element of oncogenic KRAS and strategies to down-regulate transcription”
presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie
Biomediche, Università degli Studi
di Udine.

-         
2009  contratto di collaborazione
all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Colture cellulari,
purificazione di proteine, transfezioni, dosaggi real-time PCR di trascritti”
per le esigenze del progetto di ricerca dal titolo “Formazione di strutture
G-quadruplex nel promotore di KRAS e loro coinvolgimento nel controllo della
trascrizione.” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie
Biomediche, Università degli Studi
di Udine.

-         
2009-11 contratto di
collaborazione all’attività di ricerca per svolgere il progetto “Meccanismo
di regolazione della trascrizione nei geni RAS e identificazione di proteine
specifiche per G4-DNA” per le esigenze del progetto di ricerca dal titolo
“Formazione di strutture G-quadruplex nel promotore di KRAS e loro
coinvolgimento nel controllo della trascrizione” presso la Sezione di
Biochimica del Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biomediche, Università degli Studi di Udine.

-         
2012 ad oggi assegno
di ricerca dal titolo: “Studio della regolazione del promotore di KRAS e
sviluppo di oligonucleotidi decoy per inibire la trascrizione a scopo
terapeutico.” presso la Sezione di Biochimica del Dipartimento di Scienze Mediche e Biologiche,
Università degli Studi di Udine.

-         
2014 ottiene l’Abilitazione
Scientifica Nazionale alle funzioni di professore di seconda fascia per il settore
concorsuale 05/E1 Biochimica generale e biochimica clinica.

Partecipazione a progetti:

partecipazione scientifica a progetti di ricerca internazionali e
nazionali, ammessi al finanziamento sulla base di bandi competitivi che
prevedano la revisione tra pari

-PRIN 2001 Utilizzo di nuovi effettori anti-gene e antisenso per
il controllo della proliferazione di cellule tumorali: oligonucleotidi legati
al glicole polietilenico, PNA coniugato a peptidi basici. Durata: 22 mesi.

-PRIN 2003 Utilizzo di PNA coniugato al polietileneglicole e a
peptidi basici per inibire la progressione neoplastica di cellule di carcinoma
pancreatico. Durata: 22 mesi.

-PRIN 2007 Formazione di strutture G-quadruplex nel promotore di
KRAS e loro coinvolgimento nel controllo della trascrizione. Durata: 3 mesi.

-AIRC 2007 Characterization of a
regulatory cis-element of oncogenic Kras and strategies to downregulate
transcription. Durata:
24 mesi.

-PRIN 2009 Sviluppo di oligonucleotidi G-decoys ad elevata
attività antiproliferativa specifici per gli oncogeni umani KRAS e HRAS.
Durata: 6 mesi.

-AIRC 2010 Molecular targeting of oncogenes:
rationale design of anticancer drugs directed against KRAS. Durata: 33 mesi.

Pubblicazioni
recenti di maggior rilievo:

Cogoi S, Paramasivam M, Spolaore B
and. Xodo LE (2008) Structural polymorphism within a regulatory element of
the human KRAS promoter: formation of G4-DNA recognized by nuclear proteins. Nucleic Acids Res. 36: 3765-80.

Cogoi S, Paramasivam M,
Filichev V, Géci I, Pedersen EB, Xodo LE (2009) Identification of a new
G-quadruplex motif in the KRAS promoter and design of pyrene-modified G4-decoys
with antiproliferative activity in pancreatic cancer cells. J Med Chem, 52: 564-8.

Cogoi
S
, Paramasivam M, Membrino A, Yokoyama KK, Xodo LE.
(2010) The KRAS promoter responds to Myc-associated zinc finger and
poly(ADP-ribose) polymerase 1 proteins, which recognize a critical
quadruplex-forming GA-element. J Biol Chem. 285(29): 22003-16.

Cogoi S, Shchekotikhin AE, Membrino A,
Sinkevich YB, Xodo LE. (2013) Guanidino anthrathiophenediones as G-quadruplex
binders: uptake, intracellular localization and anti Harvey-ras gene activity
in bladder cancer cells. J Med Chem. 56(7): 2764-78.

Cogoi
S
, Zorzet S, Rapozzi V, Géci I, Pedersen EB, Xodo LE.
(2013) MAZ-binding G4-decoy with locked nucleic acid and twisted intercalating
nucleic acid modifications suppresses KRAS in pancreatic cancer cells and
delays tumor growth in mice. Nucleic
Acids Res
., 41(7): 4049-64.

Cogoi S, Shchekotikhin AE, Xodo LE.
(2014) HRAS is silenced by two neighboring G-quadruplexes
and activated by MAZ, a zinc-finger transcription factor with DNA unfolding
property.
Nucleic Acids Res. 42(13):
8379-88.

Alcune attività didattiche:

- 16-20 luglio 2001 componente del corso opzionale pratico
BCH-202 dal titolo “Modulazione dell’espressione di oncogeni mediante molecole
antisenso a PNA” presso la Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università
degli Studi di Udine.

- Anno Accademico 2003-2004 contratto per lo svolgimento del
modulo di Esercitazioni di Chimica Biologica di 20 ore per il corso integrato
di Biochimica I presso il Corso di Laurea Interfacoltà di Biotecnologie
dell’Università degli Studi di Udine, settore scientifico disciplinare BIO/10 Biochimica.

- Anno Accademico 2012-13 laboratorio di Biochimica
nell’ambito del II modulo del corso “Equilibrio chimico, omeostasi degli
elettroliti e regolazione acido-base nell'organismo umano.”  Tenuto dal prof. Xodo presso la Scuola
Superiore dell’Università di Udine.

- Dall’anno Accademico 2012-13 ad oggi contratti di docenza
temporanea per l’insegnamento di Biochimica (BIO/10) di 24 ore nel Corso
Integrato di Meccanismi Biologici Fondamentali presso il Corso di Laurea in
Infermieristica, sede di Pordenone, dell'Università degli Studi di Udine.

Co-relatrice
in varie tesi tra cui:

2008 Alexandro Membrino: Corso di Laurea Specialistica in
Biotecnologie Sanitarie indirizzo medico presso la Facoltà di Medicina e
Chirurgia, Università degli Studi di Udine, Udine, tesi di Laurea sperimentale
intitolata: “Polimorfismo strutturale nel promotore dell’oncogene KRAS e
interazione di hnRNP A1 con strutture G4-DNA.”

2009 Manikandan Paramasivam: Dottorato di Ricerca in Scienze
Biomediche e Biotecnologiche Università degli Studi di Udine, Udine, con una
tesi intitolata “Structural polymorphism in the KRAS promoter: implications for
transcription and therapy.”

2011 Alexandro Membrino: Dottorato di Ricerca in Scienze
Biomediche e Biotecnologiche Università degli Studi di Udine, Udine, con una
tesi intitolata: “G4-DNA in gene promoters and development of anticancer
strategies.”

2013 Clara Bisaro: Corso di Laurea Specialistica in Chimica e
Tecnologie Farmaceutiche, Università degli Studi di Trieste, Trieste, tesi di
Laurea sperimentale dal titolo: “Attività antigenica di antratiofenedioni in
cellule tumorali di vescica”.

Divulgazione:

Lotta contro
il male: strategie anti-tumorali a scopo terapeutico. di Susanna Cogoi poster presentato alla Notte dei ricercatori Università di Udine, via
Margreth 3 e via Grazzano 16, 27 settembre 2013 a Udine.

Altro:

Co-organizzatrice di “International Workshop on Molecular Pathways in the
Response of Tumours to Photodynamic Therapy” svoltosi il 9-10 settembre 2011 a
Udine (Italy).

 

Guest editor nella pubblicazione del Forum on Immunopathological Diseases
and Therapeutics “Molecular Pathways in the Response of Tumours to Photodynamic
Therapy” vol. 2, Issue 3, 2011 edito da Begell House, inc. Publishers, ISSN
2151-8017, ISSN on line 2151-8025.

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